Den 17 mars 2000 instiftade STF:s styrelsens förtjänstmedalj Pro Arte Ex Libris för ”utomordentlig gärning inom exlibrismen”. Medaljen, som bäres på bröstet i mellanblått band, och har den, för medaljer, okonventionella formen av ett rektangulärt exlibris, förekommer i de tre valörerna guld, silver och brons. Iniciativtagaren och tillika donator var Lars C. Stolt.
Ovan ses de fyra första silvermedaljörerna, f.d. styrelseledamöterna Bengt Rur, Rune Molund, Bo Berndal och Lennart Hedlund mottaga utmärkelsen vid föreningens årsmöte den 3 april 2000 på Riksarkivet av ordförande Lars C. Stolt.
F.d. styrelseledamoten Ejnar Berg erhöll silvermedaljen vid ett sammanträde i november 2000.
Vid XXVIII:e internationella exlibriskongressen 2000 i Boston, USA, dekorerades av SEF:s ordförande FISAE:s president James P. Keenan, med föreningens förtjänstmedalj i brons.
Vid XXIX:e internationella exlibriskongressen 2002 i Fredrikshamn, Danmark, dekorerades av SEF:s ordförande, avgående FISAE-presidenten Klaus Rödel med Pro Arte Exlibris i brons.
Under året 2002 har Svenska Exlibrisföreningens förtjänstmedalj Pro Arte Exlibris även tilldelats …
… Lars C. Stolt, i guld, för ett långvarigt och framgångsrikt ordförandeskap (från 1985) för exlibrissamlare, för en generös inställning till samlare och konstnärer i Sverige och utlandet samt för stora insatser för att göra svensk exlibrisverksamhet känd utomlands, bl.a. genom att vara svensk delegat i FISAE vid samtliga internationella kongresser sedan 1974. Under sitt 34-åriga ledamotskap i styrelsen har Stolt även hunnit med att vara redaktör för Cirkuläret mellan 1985 och 1993,
… Per-Axel Wiktorsson, i silver, för betydande exlibristiska insatser och för ett tolvårigt ledamotskap i styrelsen som sekreterare, cirkulärredaktör och vice ordförande,
… Vladimir A. Sagerlund, i silver, för betydande exlibristiska insatser och för ett sjuårigt ledamotskap i styrelsen som sekreterare och årsboksredaktör,
… Olle Lundqvist, i silver, för betydande exlibristiska insatser och för ett 20-årigt ledamotskap i styrelsen som auktionkommissarie,
… Bror Jacques de Wærn, i silver, för sina insatser som styrelseledamot i Svenska Exlibrisföreningen i inte mindre än 28 år.
Under året 2004 har Svenska Exlibrisföreningens förtjänstmedalj Pro Arte Exlibris i silver tilldelats Peter Odentun Odenskiöld för ett sexårigt ledamotskap i styrelsen som skattmästaren.
Vid XXX:e internationella exlibriskongressen 2004 i Wels, Österrike, dekorerades av SEF:s ordförande, kongresspresident Ottmart Premstaller och kongressekreterare Heinrich R. Scheffer med Pro Arte Exlibris i brons.
Vid årsmötet 2005 tilldelades Olle Lundqvist Svenska Exlibrisföreningens förtjänstmedalj i guld för et 20-årigt ledamotskap i styrelsen.
Vid XXXI:a internationella exlibriskongressen 2006 i Nyon, Schweiz, dekorerades av SEF:s ordförande, ordförande i FISAE Josef Burch, kongressekreterare Benoît Junod och generalsekreterarei FISAE William E. Butler med Pro Arte Exlibris i brons.
Vid årsmötet 2007 tilldelades Per-Axel Wiktorsson Svenska Exlibrisföreningens förtjänstmedalj i guld för et långt och förtjänstfullt arbete i styrelsen, framförallt som cirkulärredaktör.
Vid årsmötet 2011 tilldelades Vladimir A. Sagerlund Svenska Exlibrisföreningens förtjänstmedalj i guld för hans utomordentliga insatser för föreningen och exlibrismen. I styrelsens motivering noteras bland annat att Sagerlund besitter heraldiska och konstnärliga talanger som har renderat i ett antal exlibris, bl a i form av föreningens eget exlibris till H.K.H. Kronprinsessan Victoria.